ソフトウェア

LetItB - Bayesian Estimation tool:Let It Bayesian -

About LetItB

　LetItBは、生化学反応系におけるパラメータ同定のための支援ツールとして開発されました。SBMLファイル（システム生物における生化学反応モデルの標準記述フォーマット）を入力ファイルとして受け取り、そのモデルに対して以下の操作を可視的に実行することができます。

  • 生化学反応経路のブロック図の作成
  • シミュレーションの実行
  • 与えられた実験データ（各分子の濃度時系列）を最も良く再現できる反応パラメータの同定およびその信頼区間の近似
  • 与えられた実験データに対して、データの再現性とモデルの複雑さを考慮した定量的なモデル妥当性の評価

また、これらの結果は、簡単なGUI操作でテキストファイルやjpegやpngなどの画像ファイルとして保存することができます。

LetItB overview

LetItBは、内部計算エンジン部分をC言語を用いて、Graphic User Interface部分をQt toolkitを用いて開発されているため、適切なライブラリ群が事前にインストールしてあれば、Windows, Mac OS X, Linux系OSのいずれのプラットフォームでも実行および再コンパイルが可能です。